Bioquímica
Química orgánica
QUÍMICA ORGÁNICA
Estudia los compuestos que contienen carbono.
CARACTERÍSTICAS
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Generalmente son no polares. El carbono y el hidrógeno en particular forman enlaces no polares debido a que tienen casi la misma electronegatividad.
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Son insolubles en agua
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Son solubles en líquidos orgánicos.
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Sus puntos de fusión y ebullición son bajos.
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La mayoría son no electrolitos.
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Los compuestos orgánicos no se ionizan, ya que sus velocidades de reacción son menores.
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Las reacciones orgánicas son muy lentas a causa de los enlaces covalentes.
Los hidrocarburos son compuestos formados por átomos de hidrógeno y carbono, están presentes en el gas natural, petróleo o aceite crudo y depósitos de carbón.
CLASIFICACIÓN DE ACUERDO A SU ESTRUCTURA | |||
ACÍCLICOS | SATURADOS Ligadura sencilla H3C-CH3 | Normales o lineales Arborescentes o ramificados | |
NO SATURADOS Ligadura doble o triple H2C=CH2 HC=CH | Lineales Arborescentes | ||
CÍCLICOS | HOMOCÍCLICOS Cadena cerrada formada de un átomo de carbono C C C
C C | Saturados No saturados | Sencillos Arborescentes Sencillos No saturados |
HETEROCÍCLICOS Cadena cerrada en donde por lo menos un átomo de carbono está sustituido por S o N. | Saturados No saturados | Sencillos Arborescentes Sencillos No saturados |
CLASIFICACIÓN DE LOS CARBONOS
Carbón primario. Se encuentra unido a 4 hidrógenos cuando está solo y a tres en el caso de estar en una cadena.
H H H
H - C - H H - C - C - H
H H H
Secundario Se encuentra unido a 2 hidrógenos en la cadena
Terciario. Se encuentra unido a 1 átomo de hidrógeno.
CH3
CH3 - C - CH3
H
Cuaternario. No esta unido a ningún átomo de hidrógeno.
CH3
CH3 - C - CH3
CH3
HIDROCARBUROS
Los compuestos orgánicos más sencillos son los hidrocarburos que solo contienen los elementos Carbono e Hidrogeno. La sustitución de un enlace Carbono-Hidrogeno por un grupo funcional, originan las diversas clases de compuestos orgánicos, y estas clases funcionales pueden considerarse derivados de los hidrocarburos.
Dentro de la clase de compuestos conocidos como hidrocarburos hay grados diferentes y tipos diferentes de reactividad química; para clasificar las propiedades y las reacciones químicas de los hidrocarburos conviene dividirlos en varias subclases. La base de la clasificación es el numero de enlaces covalentes formados entre los átomos de Carbono de los compuestos. Si en la composición intervienen enlaces únicos de C-C, la clase se le denomina Alcanos o Hidrocarburos saturados. El término saturado significa que solo un par de electrones es compartido de manera covalente. Si la molécula tiene enlaces de C-C múltiples los compuestos se denominan según el numero de enlaces covalentes entre dos átomos unidos en la molécula (Burton y Routh, 1977).
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HIDROCARBUROS SATURADOS
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ALCANOS
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NOMENCLATURA
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HIDROCARBUROS NO SATURADOS
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ALQUENOS (Olefinas)
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NOMENCLATURA
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ALQUINOS (Acetileno)
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NOMENCLATURA
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HIDROCARBUROS CICLICOS
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HIDROCARBUROS AROMÁTICOS
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GRUPOS FUNCIONALES QUE CONTIENEN OXIGENO
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ALCOHOLES
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NOMENCLATURA
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ÉTERES
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NOMENCLATURA
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ALDEHÍDOS Y CETONAS.
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NOMENCLATURA
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ALDEHÍDOS
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CETONAS
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ÁCIDOS CARBOXILICOS
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NOMENCLATURA
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ÉSTERES
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NOMENCLATURA
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GRUPOS FUNCIONALES QUE CONTIENEN NITROGENO
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AMINAS
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NOMENCLATURA
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AMIDAS
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NOMENCLATURA
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REACCIONES
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ADICIÓN
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HALOGENACIÓN
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OXIDACIÓN
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DESHIDRATACIÓN
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HIBRIDACIÓN
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ORBITALES SIGMA ()
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ORBITALES PI ()
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HIBRIDACIÓN sp3 O TETRAEDRICA
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HIBRIDACIÓN sp2 O TRIGONAL
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HIBRIDACIÓN sp O LINEAL
El gas metano, CH4, es el mas simple de todos los hidrocarburos. Los miembros elevados de esta serie pueden prepararse sustituyendo uno o más de los Hidrógenos por uno o más átomos de C, completando las necesidades de valencia del átomo de Carbono añadido con átomos de H. La formula general es CnH2n + 2, en donde n es el número de átomos de carbono en la molécula. Cada uno de los miembros de esta serie difiere del metano por uno o más grupos CH2, formando de esta manera una serie homóloga (Burton y Routh, 1977).
La característica de identificación es que cada molécula de C esta unido a otros cuatro átomos. Los enlaces sencillos entre los átomos de C son fuertes y estables, lo que hace que los alcanos sean la clase menos reactiva de los hidrocarburos (Bloomfield, 2001)
Pentano CH3 - CH2 - CH2 - CH2 - CH3
Los cuatro primeros tienen nombres comunes (metano, etano, propano y butano), y los nombres de miembros superiores provienen del numero de Carbonos de la cadena y se le añade la terminación -ano (Burton y Routh, 1977).
Serie homóloga de los alcanos | |
Metano | CH4 |
Etano | C2H6 |
Propano | C3H8 |
Butano | C4H10 |
Pentano | C5H12 |
Hexano | C6H14 |
Existe otro tipo de nomenclatura que es la de UIQPA que consiste en: a) se emplea la terminación -ano para tener el nombre del hidrocarburo lineal, en caso de que el alcano sea ramificado se nombra la cadena continua mas larga y b) los sustituyentes se indican por un prefijo y un numero que señale su posición en la cadena (Bloomfield, 2001).
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
CH3 - CH - CH - CH2 - CH - CH2 - CH2 - CH2 - CH - CH3
CH3 CH2 CH2 - CH2 - CH3 CH3
CH3
2,9 dimetil, 3 etil, 5 propil decano
Se caracterizan por tener un doble enlace entre dos átomos de C. los átomos de C que soportan en doble enlace tienen hibridación sp2 (Flores y Ramírez, 2000)
Constituyen una serie homologa de formula empírica CnH2n, esto es contienen dos átomos de H menos que los correspondientes alcanos. Puesto que todos los átomos de C se encuentran completamente saturados con H, se les considera como hidrocarburos no saturados (Beyer y Walter, 1987).
El alqueno más sencillo es el eteno o etileno, CH2CH2 o C2H4. Las moléculas mayores de los alquenos pueden tener dos o más dobles enlaces, que pueden situarse en cualquier lugar dentro de la molécula (Bloomfield, 2001). Los alquenos pueden presentar isomería de lugar, que es cuando el doble enlace se encuentra en diferente posición en la cadena.
CH3 - CH2 - CH = CH - CH3
2- penteno
CH2 = CH - CH2 - CH2 - CH3
1-penteno
Al igual que los alcanos, utilizan la nomenclatura de la UIQPA que consiste en: a) cambiar la terminación -ano por -eno para tener el nombre del hidrocarburo lineal, en caso de que el alqueno sea ramificado se nombra la cadena continua mas larga y se empieza a numerar en el extremo que tiene más cerca la doble ligadura y b) los sustituyentes se indican por un prefijo y un numero que señale su posición en la cadena.
Si existen dos dobles ligaduras se emplea la terminación dieno; si son tres la terminación trieno, etc. (Bloomfield, 2001).
Junto a los alquenos existe otra serie homologa de hidrocarburos no saturados, los acetilenos, de forma empírica CnH2n - 2. Estos compuestos se caracterizan por la existencia de un triple enlace (Beyer y Walter, 1987).
En los alquinos, un átomo de C se une a otro, por medio de un triple enlace, formado por una unión sigma y dos uniones pi. Los carbonos que soportan la triple ligadura tienen una hibridación sp. El compuesto mas sencillo de los alquinos es el acetileno C2H2 (Flores y Ramírez, 2000).
Se utilizan las mismas reglas de la UIQPA que se emplean en la nomenclatura de alquenos, con excepción de la terminación que se sustituye por -ino (Flores y Ramírez, 2000).
Los átomos de C no solo forman moléculas de cadena recta, sino también anillos estables llamados hidrocarburos cíclicos, pueden ser de diversos tamaños y a menudo contienen tanto enlaces simples como dobles. A los hidrocarburos cíclicos se les nombra de acuerdo a las mismas reglas para los hidrocarburos de cadena recta, con la excepción de que el nombre no sustituido empieza con el prefijo ciclo-. (Bloomfield, 2001).
CH2 CH2
CH2 CH2 CH2 CH2
CH2 CH2 CH2
CH2
Ciclohexano Ciclobutano
CH
CH CH CH CH
CH2 CH2 CH CH
CH2 CH
Ciclopenteno 1,3,5 Ciclohexatrieno Benceno
El benceno y los compuestos que se asemejan en comportamiento químico, se conocen como hidrocarburos aromáticos y se caracterizan por su tendencia a dar reacciones de sustitución iónica. Tiene formula molecular C6H6 (Flores y Ramírez, 2000). Los compuestos más conocidos son:
OH CH3
C C
CH CH CH CH
CH CH CH CH
CH CH
Fenol Tolueno
NO2 COOH NH2
CH CH CH
CH CH CH CH CH CH
CH CH CH CH CH CH
CH CH CH
Nitrobenceno Ácido benzoico Anilina
CH3
C
NO2 C C NO2
CH CH
C
NO2
Trinitrotolueno
Son aquellos compuestos en los que el grupo OH se encuentra unido a un átomo de C. Se deriva de los alcanos por intercambio de un átomo de H por un grupo OH y constituyen una serie homologa de formula empírica CnH2n+1-OH (Beyer y Walter, 1987).
Los nombres se forman utilizando el nombre del hidrocarburo correspondiente y la terminación -ol o escribiendo primero la palabra alcohol y la terminación -ílico. Si el carbón es secundario o terciario se indica el número del carbón donde se localiza el grupo OH.
CH3
CH3 - C - CH2 - CH2 - CH2 - CH3 2 metil hexanol
OH
CH3CH2CH2OH Propanol o alcohol propílico
Una molécula orgánica que tiene un átomo de O enlazado a dos de C (Bloomfield, 2001). Tienen la formula general R - O - R . Se pueden considerar como derivados disustituidos del agua o anhídridos de los alcoholes, en los que ambos átomos de H se sustituyen por restos de alquilo (Beyer y Walter, 1987).
Se nombran indicando los grupos hidrocarbonatos unidos al O, precedidos de la palabra éter. Si los dos grupos de un éter son iguales, se clasifican como simple o simétrico y al nombrarlo, frecuentemente se omite el prefijo di. En caso contrario se clasifica como éter mixto o asimétrico (Flores y Ramírez, 2000).
CH3CH2-O-CH2CH3 Éter etílico, éter dietílico o etilo-oxi-etilo
CH3CH2-O-CH3 Éter etil metílico
Hay dos clases de compuestos que contienen el grupo carbonilo, C=O, los aldehídos y las cetonas: un átomo de O enlazado doblemente con un átomo de C. la diferencia en propiedades entre aldehídos y cetonas se debe a la posición del grupo carbonilo (Bloomfield, 2001).
Los aldehídos tienen la formula general R-CH=O (el grupo carbonilo esta en el C primario) y las cetonas R-CO-R (el grupo carbonilo esta en el C secundario) (Flores y Ramírez, 2000)
Se nombran seleccionando la cadena hidrocarbonada mas larga que contenga el grupo carbonilo y sustituyendo entonces la -o final del alcano correspondiente por la partícula -al. El grupo carbonilo en los aldehídos esta siempre situado en el carbono terminal, así que no es necesario indicar su posición (Bloomfield, 2001).
CH3CH2CH=O o CH2 - CH2 - C - H
O
propanal
CH3 - CH2 - CH2 - CH2 - C - H
O
hexanal
Se nombran seleccionando la cadena hidrocarbonada más larga, que contenga el grupo carbonilo y sustituyendo la -o final del alcano correspondiente por la terminación -ona. La posición del grupo carbonilo se indica con un numero antes del nombre (Bloomfield, 2001).
CH3 - C - CH2 - CH2 - CH2 - CH3
O
2 hexanona o metil butil cetona
CH3 - CH2 - C - CH2 - CH3
O
3 pentanona o dietil cetona
Los ácidos carboxílicos contienen un grupo carboxilo (-COOH), unido a un grupo alquilo (R-COOH) o a un grupo arilo (Ar-COOH). El nombre carboxilo, con que se designa a la función (-COOH), es una contracción de carbonilo y oxhidrilo. El grupo carboxilo se encuentra en los extremos de las cadenas hidrocarbonadas y siempre en C primario (Flores y Ramírez, 2000).
CH3COOH Ácido etanoico o acético
CH3CH2CH2CH2CH2COOH Ácido hexanoico
Se nombran quitando la letra -o final del alcano que tenga la cadena de la misma longitud y añadiendo el sufijo -oico, y precediendo al nombre con la palabra ácido. Los átomos de C en la molécula del ácido carboxílico siempre se numeran empezando con el grupo carboxilo. Los nombres de los ácidos dicarboxílicos (ácidos orgánicos con grupos carboxílicos en cada extremo de la molécula) termina con el sufijo -dioico y son precedidos por la palabra ácido (Bloomfield, 2001).
HCOOH Ácido metanoico o ácido fórmico.
CH3 (CH2)7CH=CH (CH2)7CO2H Ácido oleico.
HO2CCO2H Ácido oxálico.
Una clase importante de compuestos derivados de los ácidos carboxílicos la constituyen los ésteres, cuyas moléculas contienen el grupo funcional éster (R-COO-R). Los ésteres se reconocen por su aroma agradable y constituyen la fuente de los aromas de las flores y de los sabores de las frutas. Son producidos por la reacción de un alcohol y un ácido carboxílico en presencia de un catalizador ácido (Bloomfield, 2001).
Se forma del nombre del ácido del cual proviene, eliminando la palabra ácido, cambiando la terminación -ico por -ato e indicando el nombre del grupo alquilo o arilo del alcohol que lo formo (Flores y Ramírez, 2000).
CH3 - COO - CH3 Etanoato
CH3 - CH2 - COO - CH2 - CH3 Propanoato de etilo
CH3 - (CH2)2 COO CH3 Butanoato de metilo
Son compuestos orgánicos que contienen el grupo funcional amino, -NH2 (formula general R - NH2). Se derivan del amoníaco por sustitución de 1,2 ó 3 hidrógenos por radicales alquilo (Bloomfield, 2001). Las aminas pueden clasificarse como primarias, secundarias o terciarias dependiendo del numero de átomos de C enlazados directamente al átomo de N (Ouellette, 1970).
Las aminas alifáticas se nombran usando el nombre del grupo alquilo seguido de la palabra amina. Si se encuentran presentes sustituyentes que sean idénticos, se emplean los prefijos di y tri (Ouellette, 1970).
CH3NH2 metil amina
CH3CH2NHCH3 etilmetil amina
CH3 - N - CH3 trimetil amina
CH3
Las amidas son derivadas de los ácidos carboxílicos, en los cuales el grupo hidroxilo (-OH) del grupo carboxilo ha sido sustituido por un grupo amino (-NH2). Por lo tanto, la formula general de las amidas puede ser RCONHR'. El enlace entre carbono y el átomo de nitrógeno en una molécula de amida, se conoce como el enlace amido (Bloomfield, 2001).
Las amidas que tienen dos H unidos al N se nombran quitando la terminación -ico u -oico del nombre del ácido original y añadiendo la terminación -amida. Si una amida contiene grupos unidos al N, éstos se nombran como grupos alquilos, pero con una N delante del nombre, para indicar que está unido al nitrógeno (Bloomfield, 2001).
Es una de las reacciones mas comunes que llevan a cabo los alquenos, uno de los reactivos se adiciona a la doble ligadura C-C, creando un producto de adición donde los componentes del reactivo se relacionan mediante uniones sencillas a cada C de los que originalmente hacían doble ligadura. El factor causante de esta reacción general, es el de electrones de la doble ligadura, porque son susceptibles de reaccionar con electrófilos. Los halógenos Cl, Br y I así como los halogenuros de H respectivos y el H2O pueden agregarse a una doble ligadura (Ouellette, 1970).
CH2=CH2 + Br2 2(CH2Br)
Los alcanos reaccionan con los halógenos (F2, Cl2, Br2, I2) que fructifican en halogenuros de H y productos orgánicos en donde los átomos de H han sido sustituidos por átomos de halógeno (Ouellette, 1970).
También son llamadas reacciones de sustitución, porque se sustituye otro átomo o grupo de átomos por uno o más de los átomos de hidrogeno del alcano (Bloomfield, 2001).
CH4 + Cl2 CH3Cl + HCl
La forma más conocida de los alcanos es como combustible, por lo tanto una reacción que experimentan es la combustión. Todos los alcanos se quemarán formando CO2 y H2O siempre que exista un punto de ignición y el suficiente O2. Los átomos de O2 del aire se combinan con los del C e H y son enlazados. Reacción exotérmica y los productos finales son CO2 y H2O. La ecuación de la reacción de oxidación que tiene lugar cuando se quema el metano es:
CH4 + 2O2 CO2 + 2H2O + Energía
Si hay una cantidad insuficiente de O2 se efectúa una combustión incompleta, resultando como productos finales el CO y H2O:
2CH4 + 3O2 2CO + 4H2O + Energía
(Bloomfield, 2001).
Al número de calorías liberadas por mol del alcano se le conoce como calor de combustión y este valor es de 211 kcal/mol para el metano (Ouellette, 1970).
La reacción de deshidratación de un alcohol se produce por la remoción de una molécula de agua del alcohol y se forma un hidrocarburo no saturado. El proceso de deshidratación puede realizarse por la aplicación de calor, pero en la mayoría de los casos se requiere un agente deshidratante (Bloomfield, 2001).
CH3CH2OH CH2=CH2 + H2O
Esta propiedad excepcional del átomo de carbono explica su tetravalencia y su combinación entre sí mismo para formar compuestos en forma de cadenas o anillos y en número muy grande. Estos compuestos son los orgánicos y pueden ser simples, dobles y triples ligaduras o enlaces.
Es aquel en el que por lo menos uno de los electrones participantes es de tipo s, o ha resultado en una hibridación donde participó un orbital s. Así, los orbitales s, sp3, sp2, sp originan orbitales o enlaces sigma. Este enlace es muy fuerte, origina simples ligaduras y es un enlace muy estable.
Se forma por la unión de electrones en orbitales p. Este enlace es adicional, débil, y en el caso del carbono, envuelve al orbital sigma. El enlace pi () es muy reactivo y genera dobles o triples ligaduras.
Al observar el comportamiento del metano se encuentra experimentalmente que los enlaces con cada uno de los cuatro H son equivalentes. Esto no se puede explicar mediante la configuración electrónica del C al estado basal (Flores y Ramírez, 2000).
En esta configuración existen dos orbítales puros desapareados y uno vació, lo que podría explicar dos uniones covalentes y una coordinada. Para explicar la tetravalencia del C, es necesario modificar el modelo, siempre con base en las ideas elementales de la teoría quántica. Por la adición de energía uno de los electrones del orbital 2s se excita y se transfiere al orbital 2p vació, quedando
Este modelo ya explica la tetravalencia, pero no la equivalencia de los 4 enlaces, porque al formarse las uniones, habría 3 enlaces iguales (con los orbítales p) y uno diferente (con el orbital s) lo que es contrario a la equivalencia observada (Flores y Ramírez, 2000).
El átomo de C debe sufrir algún cambio en sus orbitales que explique la equivalencia de los 4 enlaces. Los orbitales el átomo de C se combinan y dan lugar a la formación de orbitales híbridos; es decir, orbitales que resultan de un rearreglo entre orbitales puros. En este caso, se rearreglan el orbital 2s y los 3 orbitales 2p, formándose 4 orbitales híbridos con el mismo contenido energético, la misma forma y distribuidos en el espacio, con la misma simetría (Flores y Ramírez, 2000).
Estos orbítales híbridos son llamados sp3, porque surgen de la combinación de un orbítales y tres orbítales p. Están distribuidos de forma tal, que quedan entre si lo mas alejados posible y se dirigen hacia los vértices de un tetraedro regular. El ángulo entre cualquier par de orbítales es de 109.5º (Flores y Ramírez, 2000).
El etino es el compuesto más simple de la serie de los alquenos. Cada uno de sus átomos de C se une a 3 átomos de H por enlaces simples y a uno de carbono por doble enlace. Estudios sobre su comportamiento químico lo explican modificando el modelo del estado basal del C y proponiendo la hibridación sp2. Partiendo del estado basal del C, se promueve por medio de energía, en electrón del orbital 2s al 2pz que está vacío.
Se rearreglan 3 orbitales puros, el 2s, el 2px y el 2py, dando lugar a 3 orbitales híbridos sp2 que son equivalentes entre si y queda un orbital puro, el 2pz (Flores y Ramírez, 2000).
Los orbitales sp2 tienen el mismo contenido energético y forma, dirigidos, en el espacio, hacia los vértices de un triángulo equilátero. Distribución que les permite estar lo mas alejados uno del otro; el ángulo entre cada par de orbitales híbridos es de 120º (Flores y Ramírez, 2000).
El etino es el primer compuesto de la serie de los alquinos. Cada uno de sus átomos de C se una a dos átomos: a uno de H por unión sencilla y a uno de C por triple enlace, su comportamiento se explica mediante la hibridación sp. Siguiendo la secuencia de las hibridaciones sp3 y sp2 y rearreglando solo 2 orbitales el 2s y el 2p tenemos:
El resultado es dos orbitales híbridos, denominados sp y dos orbitales p puros. Los orbitales híbridos sp tienen el mismo contenido energético y forma. En este caso, la máxima simetría se alcanza al estar uno opuesto al otro y el ángulo entre ellos es de 180º (Flores y Ramírez, 2000).
REFERENCIAS
Beyer, H. y Walter, W., 1987, Manual de Química Orgánica, Ed. Reverté, España, 65, 99, 121 y 155.
Bloomfield, M. M., 2001, Química de los Organismos Vivos, Ed. Limusa, México, 377-382,384, 387, 397, 409, 438, 440, 442, 447-449, 468, 469, 475 y 476.
Burton, D.J. y Routh, J.I., 1977, Química Orgánica y Bioquímica, Ed. Mc Graw-Hill Interamericana, México.
Flores, L.T. y Ramírez, D.A., 2000, Química Orgánica para Nivel Medio Superior, Ed. Esfinge, 12ª ed., México, 28-30, 80-82, 112, 114, 144, 199, 200, 226, 227, 232, 246 y 276.
Ouellette, J.R., 1970, Introducción a la Química Orgánica, Ed. Harper & Row, Nueva York, 75, 78, 115 y 280.
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