Examen de Bioquímica

Proteínas. Enzimas. Bioenergética. Hidratos de Carbono. Glicólisis. Complejo Piruvato Deshidrogenada. Gluconeogenesis. Oxidación de Acidos grasos. Lipidos. Síntesis de Acidos grasos. Catabolismo de Aminoácidos. Ciclo de Urea

  • Enviado por: Monica
  • Idioma: castellano
  • País: Chile Chile
  • 10 páginas
publicidad
publicidad

Bioquímica.

  • Proteínas 'Examen de Bioqumica'

Se forman por aminoácidos que se unen atravez de enlaces peptidicos.

Hay 20 aminoacidos , La glicina es el unico aminoácido Aquiral .

Enlace peptídico : - Es enlace covalente

- Se forma entre un grupo amino y uno carboxilo

- No hay rotacion .

Estructuras de las proteinas.

-Primaria : Enlace peptídico y puente disulfuro
-Secundaria : Enlaces de H+ entre as cadenas laterales. Poseen Helices Alfa y laminas beta .

-Terciaria : Enlaces ionicos ( van der walls )

- Cuaternaria : Enlaces covalentes ( pte H )

Punto isoelectrico : PK1 : acido PK2 : base

- Para Aminoácidos acidos. : Pi : ( PK1 + PKr ) / 2

- Para aminoácidos basicos : Pi : ( PK2 + PKr) / 2

- Para aminoácidos neutros : Pi : ( PK1 + PK 2) / 2

Acido : cede electrones

Base: capta electrones .

P ka : ph en el que un ac debil pierde un electrón y llega al quilibrio .

Region tamponante : Pka +- 1

Punto Isoelectrico : ph al cual la molécula tiene carga neta igual a cero .

Punto inflexión : Ph = Pka

  • Enzimas 'Examen de Bioqumica'

Las enzimas catalizan (apuran) reacciones quimicas, esto pasa por que bajan la barrera de activacion .Algunas de ellas necesitan de grupos prosteticos ; cofactores o coenzimas .

Cofactor : iones inorganicos : metales

Coenzima : iones organicos. Ej NADH , FAD , NADPH

Holoenzima : enzima unida asu cofactor o coenzima
Apoenzima : solo la parte proteica de la enzima

Reacciones

  • Espontanea : Δ G = negativo , favorece la formación de productos.

  • No espontanea : Δ G = positivo , hay mas sustratos .

  • En equilibrio Δ G = 0

Cinética Enzimática.

Mide la velocidad de la reaccion .

La velocidad máxima ( V max ) se alcanza cuando no hay mas sitios activos disponibles para el sustrato .

1 Km 1 ---- = -------- + ------ Vo Vmax Vmax

Formula de michaellis :

Km : es la mitad de la velocidad maxima


Inhibición Enzimatica.

  • Irreversibles

  • Reversibles : - Competitiva: Vmax : matiene Km : aumenta

  • - Acompetitva: Vmax : disminuye Km :disminuye

    - Mixta : Vmax: Disminuye Km : aumenta.

    Si la Vmax aumenta la Km disminuye y/o viceversa.

    'Examen de Bioqumica'
    Bioenegertica 'Examen de Bioqumica'

    Es el estudio cuantitativo de la energia necesaria para que ocurran los procesos quimicos dentro de la celula .

    Clasificaciones de las reacciones .

    • Exergonicas : ocurren de manera espontanea , favorenciendo la formación de productos mas energia .

    • Endergonicas : no ocurren de manera espontanea , por lo que necesitan energia `para poder ocurris .

    • G = H - TS

      Energia Libre de GIbs

      H : entalpia : calor asociado a la reaccion
      T : temperatura
      S : Entropía : Desorden en una reaccion quimica.

      Δ G' = - R T Ln Keq

      Energia libre estandar ( biologico)

      Keq = productos

      --------------

      Reactantes

      Reacciones Redox ( oxido reduccion)

      NADH NAD = oxidación .

      NAD NADH = reduccion .

      'Examen de Bioqumica'
      Hidratos de Carbono 'Examen de Bioqumica'

      - Su formula general es : C1H2nOn

      - Son Almacen de energia , son azucares .

      - Si esta azucar tiene un grupo aldehido se llaman Aldosas , si tienen un grupo cetona se llaman cetosas

      Estructuras moleculares.

      • Isomeros : ( espejo ) igual formula , distinta distribución

      • Epimeros: Se diferencia en la posición de OH de un carbono.

      • Anomeros : ( tiene que estar ciclado el azucar ) . Solo se compara una misma azucar y tiene relacion con la posision del OH ; alfa abajo , beta arriba .

      • Enantiomeros : Relacion con el ultimo OH de la cadena , si esta hacia la derecha es D , si esta a la izquierda es L.

      • Diasteroisomeros : tienen muchos carbonos distintos.

      La Glucosa es un azucar del tipo hexosa y aldosa .

      Glicolisis 'Examen de Bioqumica'

      Es la vía metabólica encargada de oxidar la glucosa con la finalidad de obtener energía para la célula. Consiste en 10 reacciones enzimáticas consecutivas que convierten a la glucosa en dos moléculas de piruvato el cual es capaz de seguir otras vías metabólicas y así continuar entregando energía al organismo

      Hay dos etapas - Preparativa , en la que se gasta ATP , en la reaccion 1 y 3

      - Productiva , en la que produce ATP , en la reaccion 6 (NADH ), 7 y 10 ATP

      Regulación de la glicólisis .

      • 1 paso : hexoquinasa ; glucosa -> glucosa 6P

      Activada : AMP Inhibida : Glucosa 6 fosfato

      Fructosa 2,6 bifosfato ATP

      Acetil Co A

      • Complejo Piruvato Deshidrogenada 'Examen de Bioqumica'

      2 mol priuvato - 2 mol Acetil Co A

      • Ocurre en la matriz mitocondrial
        - Ocurre por la accion de 3 enzimas :

      E1 : prituvato deshidrogenasa , su coenzima es TTP

      E2 : dihidrolipoil transatilasa , su coenzima es Lipoato
      E3 : dihidrolipoil deshidrogenasa

      Activada : AMP Inhibida : ATP

      NAD+ Acetil CoA

      NADH

      Fermentación

      En este proceso no se necesita oxigeno Anaerobico

      Hay dos tipos de fermentación

      Alcoholica : son 2 reacciones -piruvato acetaldehído + CO2
      - Acetaldehído + NADH Etanol + NAD+


      **ocurre por la accion de la enzima : piruvato descarboxilasa.

      Lactica : ocurre en 1 reaccion - Piruvato + NADH Ac lactico + NAD+

      **ocurre por la accion de la enzima deshidrogenasa.

      • Ciclo de Krebs

      El ciclo de krebs se activa cuando hay poco ATP por enden hay mucho AMP .

      Los productos de 1 vuelta del ciclo es : 3 NADH

      2 CO2

      1 FADH2
      1 ATP

      Reaccion 5 : GTP

      Reaccion 3 4 8 NADH

      Reaccion 6 FADH2

      Activado : AMP Inhibido : ATP

      NADH

      Succinil CoA

      Citrato

      • Fosforilacion oxidativa

      - Ocurre en la membrana interna .

      - Las moléculas de NADH y de FADH2 son llevadas a fosforilacion oxidativa para producir ATP gracias a la enzima ATP sintasa.


      1 mol de NADH son 3 mol de ATP

      1 mol de FADH2 son 2 mol de ATP

      El NADH producido en el ciclo de krebs va al C1 C3 C4
      El FADH2 producido en el ciclo de krebs va al C2 C3 C4

      Del C1 salen 4 protones.

      Del C3 salen 4 protones.

      Del C4 salen 2 protones.

      Complejo I → NADH deshidrogenasa

      Complejo II → Succinato deshidrogenasa

      Complejo III → Citocromo c reductasa

      Complejo IV → Citocromo c oxidasa


      Inhibidores Activado

      Rotenona y amital C1 NADH
      Cianuro monoxido C4 FADH

      Antimicina A C3

      • Via de las pentosas fosfato

      - El objetivo es producir NADPH y ribosa 5 Fosfato .
      - El NADPH es ocupado en la síntesis de acidos grasos.

      Tiene dos etapas .

      Fase Oxidativa : En esta etapa se obtienen 2 NADH

      Se parte de glucosa 6P hasta obtener Ribosa 5P

      Fase No oxidativa : convierte hexosas en pentosas.
      enzimas : - transcetolasas . ribosa 5P Gliceraldehido 3P

      - transaldolasas gliceraldehido fructosa 6P


      Activado : inhibido :

      NADP+


      Glicógeno

      - Es el almacenamiento de la glucosa .

      Síntesis Degradación.

      Sustrato : UDP glucosa
      iniciador : glicogenia

      Elongacion : Ruptura :

      -Glicógeno sintasa :alfa 1-4 - Glicógeno fosforilasa : alfa 1-4
      - Ramificante : alfa 1-6 - Desramificante Glucosidasa rompe

      Enlaces alfa 1-6

      transferasa

      Activada : Inhibida :

      UDP
      Glucosa.

      • Gluconeogenesis

      • síntesis de glucosa a partir de precursores no glucosidicos .
        - Ocurre en el higado .

      frutosa 2,6 bifosfato activa PFK Activa glicolisis

      inhibe fructosa 1,6 bifosfato inhibe gluconeogenesis.

      Se puede hacer gluconeogenesis a partir de piruvato y lactato ambos deben llegar a fosfoenolpiruvato .

      Piruvato oxaloacetato malato oxaloacetato fosfoenolpiruvato

      Lactato oxaloacetato fofoenolpiruvato.

      Lipidos

      Su funciones son almacenamiento de energia

      constituyente de membrana.

      Hay dos categorías de lipidos Saturados , solidos
      insaturados ,liquidos.

      El triglicérido , es un lipido que se almacena en el tejido adiposo .Esta formado por la cabeza de glicerol y 3 acidos grasos .

      Para sacar los acidos grasos del triglicérido , se ocupa una enzima llamada lipasa .



      Oxidación de Acidos grasos

      Ocurre en 3 pasos.

      1 paso: Activacion del acido graso.

      - Ocurre en la membrana externa de la mitocondria.
      - La enzima que activa el acido graso es la acil coa sintetiza .

      2 paso : Transporte del acido graso al interior de la mitocondria .

      • El acil coA no puede atravesar la membrana por lo que la carnitina le quita el COa y le pone la carnitina , esto por la enzima carnitina acil transferasa I. Luego cuando estan en la matriz , la carnitina acil transferasa II le devuelve el coA al acido.


        3 paso : Beta oxidación.

      Oxidación por FAD
      Hidratación
      Oxidación por NAD
      Tiolisis


      Síntesis de Acidos grasos

      • Ocurre en el citoplasma .
        - Reacciones endergonicas
        - oxidación de NAPH

      • -reacciones de reduccion .

      1 paso : Síntesis de malonil coA .

      - Es una reaccion irreversible , por lo que es una etapa limitante , entonces es el mayor putno de control en la síntesis de acidos grasos.

      Bicarbonato + Acetil co A Malonil co A
      * por la acetil coa carboxilasa , gastando un ATP .



      Activado : citrato inhibido : ac grasos de cadena larga.

      2 paso : Transporta de grupos acilos y malonilos .

      Primero el acetil se une a la proyeccion pequeña del complejo acido graso sintasa y luego el Malonil se une a la proyeccion grande


      3 paso : Ciclo de elongacion .

      Condensación
      Reducción por NADPH
      Deshidratación
      Reducción por NADPH


      - Todo esto ocurre hasta generar una cadena de 16 carbono ,luego de eso solo de une acetil .

      Reaccion general
      8 Acetil coA + 14 NADPH + 7 ATP Palmitato + 8 CoA + 7 ADP + 14 NADP+

      Activada : citrato Liasa inhibida : glucagon ( inhibe
      Acetil CoA carboxilasa la acetil Coa Carboxilasa

      Insulina


      Catabolismo de Aminoácidos

      - Ocurre en el higado .
      - Un aminoácido esta compuesto por un esqueleto carbonado y un grupo amino .
      El esqueleto carbonado se usa en acetil Coa y en intermediarios del ciclo de krebs.
      y el grupo amino es reciclado para formar otros aminoácidos y su exceso es llevado al ciclo de la urea.

      El primer paso en el catabolismo de aminoácidos es el proceso de desaminacion , es decir el grupo amino es traspasado al alfa ceto glutarato por la enzima amino transferasa formando glutamato.

      Alfa ceto Glutarato + aminoácido Glutamato + alfa ceto acido .

      Luego ocurre la deaminacion oxidativa , que ocurre a nivel de la matriz mitocondrial , en este paso se pierde el grupo amino del glutamato .
      Activado . ADP
      glutamato + agua alfa cetoglutarato + amonio Inhibido : GTP

      Este proceso ocurre por la accion de la enzima glutamato deshidrogenasa , ocupando NADP o NAD+


      Hay distintas formas de transportar el amonio , estas son :

      Alanina : solo del musculo
      Glutamina : del músculo y otros tejidos.

      Ciclo de la Urea

      El exceso de amonio es llevado al ciclo de la urea.
      Ocurren 5 pasos , solo el primero ocurre en la mitocondria luego en el citosol .

      Lo primero en suceser es que el amonio pasa a carbamoil fosfato por la enzima carbamoil fosfato sintetasa 1 , con el consumo de 2 ATP .

      Luego la carbamoil junto a la ornitina pasa a citrulina , este es el primer paso .

      Ahora la citrulina sale al citosol , y en este paso se utiliza ATP y aspartato (ciclo de krebs ) para formar arginina succinato

      En el paso 3 suelta fumarato y forma arginina .

      Finalmente arginina es convertida en ornitina , liberando urea .

      - El amonio viene del aspartato y del glutamato .
      - El ciclo de la urea y el ciclo de krebs se relacion por aspartato y fumarato .

      Activado : N- acetil glutamato
      activa la carbamoil fosfato sintetasa 1


      Enfermedades

      -
      Fenilcetenuria : problemas con la fenilalanina hidroxilasa , provocando retardo mental

      - Albinismo : problemas con la enzima tirosinasa.

      - Deficiencia en carbamoil sintetasa 1 : provoca acumulación de la urea .

      Síntesis de triglicéridos


      Para formar un triglicérido se necesitan : glicerol 3 Fosfato y Acil Co A

      - El glicerol 3P proviene de glicolisis y de higado .


      Integración del metabolismo

      ATP + Creatina Fosfocreatina + ADP Enzima : creatina kinasa